Lista de Municipios Autónomos

1. "Libertad de los Pueblos Mayas"; Cabecera: Santa Rosa El Copán; en Ocosingo.
2. "San Pedro Michoacán"; Cabecera: en la Realidad; en las Margaritas.
3. "Tierra y Libertad"; Cabecera: Ejido Amparo Agua Tinta; en Las Margaritas, Independencia y Trinitaria
4. "17 de Noviembre"; Cabecera: Ejido Morelia; en Altamirano y Chanal
5. "Miguel Hidalgo y Costilla"; Cabecera: Ejido Justo Sierra; en las Margaritas y Comitán
6. "Ernesto Che Guevara"; Cabecera: Moisés Gandhi; en Ocosingo
7. "1º De Enero"; Cabecera: en Sibajcá, en Ocosingo
8. "Cabañas"; Tushakiljá en Oxchuc y Huixtán
9. "Maya"; Cabecera: Ejido Amador Hernández; en Ocosingo
10. "Francisco Gómez"; Cabecera: Ejido la Garrucha; en Ocosingo
11. "Flores Magón"; Cabecera: Ejido Taniperlas; en Ocosingo
12. "San Manuel"; Cabecera: Ranchería San Antonio; en Ocosingo
13. "San Salvador"; Cabecera: Ejido Zapata; en Ocosingo
14. "Huitiupán", en el territorio con el mismo nombre
15. "Simojovel", en el territorio con el mismo nombre
16. "Sabanilla", en el territorio con el mismo nombre
17. "Vicente Guerrero"; en el territorio llamado Palenque
18. "Trabajo", territorio de Palenque y Chilón
19. "Francisco Villa", en el territorio llamado Salto de Agua
20. "Independencia", en los territorios llamados Tila y Salto de Agua
21. "Benito Juárez", en los territorios llamados Tila, Yajalón y Tumbalá
22. "La Paz"; en los territorios llamados Tumbalá y Chilón
23. "José María Morelos y Pavón"; Cabecera: Quetzalcóatl en el territorio de Marqués de Comillas, Ocosingo.
24. "San Andrés Sacamch'en de los Pobres”; Cabecera municipal; en el territorio de San Andrés Larrainzar
25. "San Juan de La Libertad"; Cabecera municipal; en el territorio llamado El Bosque
26. "San Pedro Chenalhó"; Cabecera en Polhó; en el territorio con el mismo nombre
27. "Santa Catarina"; en los territorios llamados Pantelhó y Sitalá
28. "Bochil"; Cabecera municipal; en el mismo nombre
29. "Zinacantán"; Cabecera municipal; en el territorio con el mismo nombre
30. "Magdalena de la Paz"; Cabecera: Magdalena, en el territorio llamado Chenalhó
31.- "San Juan K'ankujk'"; en el territorio llamado San Juan Cancuc
32.-Regiones Autónomas "Tierra y Libertad"; en los territorios de las Margaritas, la Trinitaria, Frontera Comalapa, Chicomuselo, La Grandeza, El Porvenir, Siltepec, Mazapa de Madero, Bellavista, Villa Comaltitlán, Unión Juárez Tapachula, Tuxtla Chico y Motozintla.
33.- Región Autónoma Tzoj Choj; en los territorios de Altamirano, Chanal, Oxchuc, Tenejapa, Cancuc, Huixtán, San Cristóbal, Amatenango del Valle, Ocosingo, el pueblo de Abasolo y "Ernesto Che Guevara".

Fuente: http://www.ciepac.org/